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우리들의 이야기

linear mixed effects models using R

작성자박상일|작성시간14.02.18|조회수419 목록 댓글 6

davidian 교수님의 강의록을 다시 읽고, 그래도 정리가 잘 안되는 개념이 있어 몇개 챕터만 다시 읽어보니..

일부 복잡한 개념들(empirical Bayes estimation, BLUP,....)을 제외하고는 mixed model에 대한 개념이 잡히는 것 같아

실전에 응용해보려고 큰돈 들여서 구매한 책을 다시 읽어 보았습니다.


안박사님께서 이전에 간략하게 서평을 해 주신대로....

다시 책을 보니 심난하게 되어 있다는 느낌이 듭니다.

제가 잘 몰라서 그렇기도 하겠지만, 지나치게 복잡하고.....


lme4 개발자이신 Douglas Bates 교수님의 강의록이 있어 그걸 읽어 보니...

그것도 일부는 알겠는데, 일부는 어렵고.....

뭐든 쉽게 되는게 없네요....


구글링하다가 보니 대표적인 packages가 nlme와 lme4인데, 

모델진단에는 nlme가 좀더 다양한 옵션을 제공하는 것처럼 되어 잇어(http://freshbiostats.wordpress.com/2013/07/28/mixed-models-in-r-lme4-nlme-both/) 

관련 자료를 찾아서 공부해 볼까 합니다.

Pinheiro, Jose/ Bates, Douglas의 mixed effect model in S, S-plus 를 구해서 공부해 볼까 합니다..


mixed model 배우기가 쉽지 않습니다..^^

nlme나 lme4를 바로 사용할 수 있기를 기대했는데,

모델링하는 것과 각 패키지 별 함수 설정하는 것을 다시 익혀야 하니.....



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댓글

댓글 리스트
  • 답댓글 작성자박상일 작성자 본인 여부 작성자 | 작성시간 14.02.19 nlme는 2012년 이후에 업데이트가 안되는 것으로 되어 있더군요..Davidian 교수님의 강의록에도 없는 내용들이 Bates의 lme4와 Pinheiro/Bates의 이전판(2000년)에 짧은 페이지에 기술이 되어 있어, 무지 당황스러웠습니다.
    그래서 우선은 책을 구입하기 전에 구글링해서 쉽게 쓰여진 글을 찾고 있는데 대부분 Bates가 기술한 것이고, 대부분 이론 부분이 어려워 갈피를 못잡고 있습니다..^^
  • 답댓글 작성자박상일 작성자 본인 여부 작성자 | 작성시간 14.02.19 함수의 random effect term 표기가 ( | )의 형태로 되어 있는데, 이것도 기술 방식에 따라서 의미가 약간씩 다르더군요. Bates의 LME4: Mixed effect modeling with R이라는 책(?)에서도 기술이 되어 있기는 한대..Davidian 교수님 강의록 처럼 기술 자체가 쉽게 와닿지 않아서^^
  • 답댓글 작성자안재형 | 작성시간 14.02.19 박상일 Pinheiro/Bates 책은 2nd edition 안나왔습니다. 2009년은 그냥 다시 prining만 한겁니다.
  • 답댓글 작성자안재형 | 작성시간 14.02.19 박상일 저는 "|"로 표기하는게 더 익숙한데요... 자꾸 보면 괜찮을겁니다. Davidian 강의록은 정말 쉽게 쓴거고, Bates 책은 만만치는 않습니다. 그래도 데이터하고 분석이 있으니 자꾸 해보시면 감이 올겁니다. 더 이상 책 사실 필요는 없을듯합니다.
  • 답댓글 작성자박상일 작성자 본인 여부 작성자 | 작성시간 14.02.20 안재형 그렇군요. 2000년도에 프린팅 된것은 구했으니 그것으로 공부해봐야 겠습니다. 이론 부분은 건너뛰고^^ ,말씀하신대로 이론부분은 건너뛰어도 된다고 책에 쓰여 있네요^^
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