|
1)
정의
①
반응물질(영양분, 균체, 기체)이 자가촉매 반응을 일으키는
폐쇄계
폐쇄계:
산소를 제외한 모든 중요 부분이 시작부터 끝날 때까지
배출될 수 가 없다.
예)
회분식, 유가식 배양
개방계:
입출입이 가능하다. 예) 연속식, 반복 유가식 배양
②
산소 이용
통기량:
0.5-1.5 vvm(air volume/working volume/min)
2)
성장식
(1)
대수식
①
미생물학적 접근 (그림)
이분법
X/XO = 2n = 2
t/td X =
XO 2 t/td (1-1)
ln(X/XO) =
n ln2 = t/td ln 2 = 0.693 t/td
lnX=
lnXO
+ 0.693 t/td (1-2)
②
화학공학적 접근 (그림)
대수기의
성장(균형성장)은 1차 자가촉매화학 반응: 특정시간에서
세포의 증가 속도는 그 시간의 세포 수에 비례
ln(X/XO) =
μt (1-3)
X = XO exp(μt) (1-4)
③
두 식의 연결: 2배 증가시간(td)
(1-3)에서
ln2 = μtd = 0.693 (1-5)
(1-2)을
다시 나타내면 lnX= lnXO + 1.443 t/td = lnXO
+ μt
④
만약 대장균이 20분마다 분열하여 48시간 대수 증식을 한다면
XO
= 10-12 g,
td = 20 min
(1-5)에서 μ = 0.693/(1/3) = 2.08 h-1
X = XO exp(μt)에서 X = 10-12 exp(2.08×48)
= 2.2 × 1031 (지구무게의 4000배)
(2)
Monod 식
(1-6)
(1-7)
(1-8)
(1)
(2) (3)에 의하여 변수 S를 제거하면
(1-9)
(1-10)
(1-11)
Xo << So YX/S
Xf
≒ So YX/S
최종세포농도와
초기기질농도의 관계: 어느값까지 비례하지만 그 이상에서는
비례하지 않는다.
비례구역:
Bioassay, 기질의 결핍
일정,
감소구역: 다른 기질의 결핍, 저해물질의 축척, 기질의
저해
(3)
생산성
총
회분 공정시간
tb = tT + tD + tL + tE
tT: turnaround
time, 생산물질 회수 시간
tD: delay
time, 다음 단계의 배양준비에 걸리는 시간
tL: lag time
tE: exponential
growth time 1/μm ln(Xf/Xo)
(1-12)
생산성
증가: 접종량 증가, tT + tD의 시간
단축, 활성이 좋은 종균 사용,
비례관계
내에서 초기 기질농도 증가, 수율이 좋은 균주 개발
(4)
속도식
①
기질 소비속도 dS/dt 산물생성속도
dP/dt
②
비 기질 소비속도 1/X dS/dt =qS 비
산물 생성속도 1/X dP/dt = qP
③
수율 YX/S = △X/△S
≒ dX/dS YP/S = △P/△S
≒ dP/dS
(5)
유지 에너지
총
기질 소비속도 = 성장에 대한 기질 소비속도 + 유지에 필요한
기질 소비속도
(1-13)
qs
vs μ 절편=m, 기울기= 1/YX/S*, 1/YX/S
vs 1/μ 절편= 1/YX/S*, 기울기=m
(6)
생산물
①
산물생성식
qP = αμ+β (1-14)
②
유도
대사결과
기질에서 세포가 생기고 생성된 세포가 일정비율 생성물
생산
1.
기질에서 세포 생성
2.
생성된 세포가 일정비율 생성물 생산
(1-15)
③
분류
1.
미생물 성장과 연결된 산물(growth-associated product):
1차 대사 산물
β=0 (그림: qP, μ vs
t 일정; qP vsμ 비례)
dP/dt =αdX/dt 또는 qP = αμ
2.
미생물 성장과 무관한 산물(non growth-associated product):
2차 대사 산물
β=0 (그림: qP, μ vs
t 차이; qP vsμ 일정)
dP/dt = βX 또는 qP = β
3.
미생물 성장과 부분적으로 관련있는 산물(partial growth-associated
product): 대부분의 산물
α≠ 0 β≠ 0 (그림: qP, μ vs
t 겹침; qP vsμ 기울기α
절편β)
qP = αμ+β
3)
성장곡선 (그림)
(1)
유도기
①
정의
미생물이
다른 환경에 옮겨졌을 때 적응하는데 걸리는 시간, 비 성장
속도가 최대치로 증가할 때까지 시간; ln(X/Xo)= μ(t-L)
L:
대수기 접선과 초기 농도의 일치점 (시간)
②
원인
1.
영양성분의 변화(저영양 -> 고영양)
2.
물리적 환경의 변화
3.
저해제의 존재
4.
포자의 발아
5.
접종균의 상태: 적거나 생존율이 적거나 오래되었을 때
예) 105/ml -> 107/ml
6.
세포막에 의한 확산과정 중 균체 내부의 성분이 희석됨
③
특징
1.
균이 환경에 적응
2.
효소단백질이 합성
3.
RNA 증가 DNA 일정
4.
세포 질량은 증가하나 세포 수는 일정
(2)
대수기
①
정의
비
성장속도가 일정한 기간; dX/dt = μm
X
균이
대수적으로 증가, 세대기간이 일정, 세포질의 합성속도와
세포수의 증가가 비례
②
조건
1.
모든 영양분이 충분(미세 성분 포함)
2.
완전한 혼합
3.
모든 세포가 성장 능력을 지님
4.
저해제가 없음
③
특징
1.
무제한 성장(unlimited growth): 모든 성장 조건(물리적,
화학적, 생물학적)이
최적
세포의 생리적 활성이 가장 강한 시기
2.
균형성장(balanced growth): 거대분자의 조성이 일정,
3.
물리적, 화학적 처리에 대한 감수성이 높은 시기
(3)
정상기
①
정의
대수기
이후 비 성장 속도가 감소하는 시기 또는 비 성장 속도가
zero인 시기
②
원인
1.
영양분의 이용성 감소 및 영양분의 고갈,
2.
새로운 딸세포의 성장 능력 감소
3.
대사 생성물이 저해제 역할 또는 독성물질의 축척,
4.
물리적 스트레스
5.
pH의 변화, 산소 부족
6.
포자의 형성
③
특징
1.
세포수는 최대, 생균수는 일정
2.
대수기와는 다른 화학적 조성
3.
포자를 형성하는 시기
4.
성장하는 세포수와 사멸하는 세포수가 동일한 시기
5.
비균형성장
(4)
사멸기
①
정의
비
성장 속도가 zero보다 작은 시기
②
특징
1.
생균수 감소
2.
세포의 사멸
3.
효소 작용에 의한 자기 소화 (용균)
1)
정의
①
영양분 첨가와 같은 양의 제거로 균체가 포함되어 있는
상태로 오랜기간 성장을
유지하는
개방 성장계
②
정상상태(steady state): 균체농도, 비 성장속도, 배양환경(기질
및 생성물의 농도)
이
시간에 따른 변화없음
chemostat:
유속 일정 turbidostat:
균체농도 일정
③
적용: 미생물이 환경에 대한 반응조사, 최적조건하에서
균체, 산물의 연속생산
④
구성장치: 배지 첨가용 용기(첨가속도 조절, 무균 reservoir),
일정부피의
배양조(pH, 온도, 통기량, 교반속도)
2)
종류
(1)
Chemostat (constant chemical)
①
일정부피 유지: 배지를 일정속도로 공급, 같은 속도로 방출(D
고정, X 변화)
②
하나의 영양분(균체농도 조절 인자)을 제외한 모든 성분
과량 존재
③
성장속도를 고정하고 환경을 변화시켜 생리적 특성 조사
(2)
Turbidostat (constant turbidity)
①
배양액의 탁도를 측정하여 유속을 변화시켜 균체농도를
일정하게 유지.
부피를
overflow device로 유지
②
세포농도가 일정하게 유지되므로 특정환경(예, 고농도 에탄올)에서
저항 균주 선별
③
적당한 균체 농도를 측정하는 기구 필요
1.
탁도 측정: spectrophotometer, laser turbidometer
2.
이산화탄소 압력 일정 유지
3.
산 생산시 pH 전극으로 조절
4.
기질농도로 조절 예) glucose analyser
5.
용존산소 측정으로 조절
6.
기체상에서 산소 또는 메탄같은 기질 소비로 측정
(3)
Plug-flow 연속배양기 (back mixing이 없는 일정 유속)
①
성장이 회분식 배양과 유사: 거리가 배양시간을 대신함
②문제점:
biomass의 부착, plug flow(back mixing이 존재), aeration을
유지하는 것이 어렵다.
③폐수처리,
혐기발효(요구르트, 치즈), 장의 균서식 모사에 사용
3)
수식
(1)
세포의 물질 수지
세포
in - 세포 out + 세포성장 = 세포축척
F/V
XO - F/V
X + μX = dX/dt
1. XO = 0 2.
F/V
= D 3.
dX/dt
=
0
-DX + μX = 0
μ=
D (생리적 인자 = 물리적 인자) (2-1)
(2)
영양성분의 물질 수지
영양분
in-영양분 out-영양분 소비(성장)+영양분 소비(유지)
= 영양분 축척
F/V
SO - F/V
S - μX/YX/S - mX
= dS/dt
1.
F/V
= D 2. m ≒ 0
3.
dS/dt
=
0
D (SO
- S) = μX/YX/S = DX/YX/S
X
= YX/S
(SO - S) (2-2)
(3)
성장 수식
DKS + DS = DCS
(2-3)
(2-2)에서
(2-4)
P = dX/dt
= μX = DX
(2-5)
(4)
산물
산물
in - 산물 out + 산물 생성 = 산물축척
F/V
PO - F/V
P + qPX = dP/dt
1.
XO = 0 2.
F/V
= D 3.
dX/dt
=
0
-DP + qPX = 0 P = qPX/D (2-6)
①
growth associated product
qP
= αμ+β β=
0 qP
= αD
(2-6)에서
P = αDX/D
=αX
②
non-growth associated product
qP
= αμ+β α=
0 qP
= β
(2-6)에서
P = βX/D
③
partially growth associated product
qP
= αμ+β
(2-6)에서
P = αX +βX/D
(5)
생산성
①
회분식 생산성
(1-12)에서
②
연속식 생산성
dP/dD
=
0에서
(2-7)
(2-4)에서
P =
DMXM = DCYX/SSO = μmaxYX/SSO
③ P(연속식)/P(회분식)
(2-8)
접종량이
최대 균체량의 5% 이면 Xf/Xo = 20, tT+tD+tL = 10시간이라면
4)
실제 Chemostat
(1)
Monod 식이 잘 안 맞음 (주로 낮은 성장속도)
①
탄소원 제한 Chemostat
탄소원을
제한하는 경우 성장속도와 상관없이 유지(maintenance)에
들어가는 탄소
에너지
량은 일정 -> 성장속도가 낮을수록 총 탄소에너지 중
유지에 들어가는
탄소에너지
량의 비율이 높아짐 -> 세포농도 감소
영양분
in-영양분 out-영양분 소비(성장)+영양분 소비(유지)
= 영양분 축척
F/V
SO - F/V
S - μX/YX/S - mX
= dS/dt
1.
F/V
= D 2. dS/dt = 0
D (SO
- S) = μX/YX/S + mX=
(D/YX/S + m)X
(2-9)
②
N-, S- 제한 Chemostat
낮은
성장속도에서 저장물질(지방, 다당류, PHB) 축척 ->
낮은 성장속도에서 세포농도
증가
세포농도를
cell protein g/L 또는 N g/L로 표시하면 이론곡선과 동일
③
P-, Mg-, K- 제한 Chemostat
낮은
성장속도에서 P-, Mg-, K- 제한 배지(RNA와 관련)에서 RNA를
적게 요구 -> 낮은
성장속도에서
P-, Mg-, K-가 세포수 증가하기에 충분
④
복합배지에서의 Chemostat
성장속도가
빨라질수록 제한되는 영양분이 많아짐 -> 성장속도가
빨라질수록 세포농도
가
서서히 감소
(2)
부적합한 기구 (주로 높은 성장속도)
①
Foam에 의한 불완전한 혼합 (D는 실험식)
dX/dt
= μX- DXF = 0 D =
μX/XF
XF>X X/XF <
1 DC
exp < DC thr
②
세포침강 (sampling tube에서)
dX/dt
= μX- DXS = 0 D =
μX/XS
XS<X X/XS >
1 DC
exp > DC thr
③
기벽성장(wall growth)
dX/dt
= μX + μwXw- DX
=
0 DX
= μX + μwXw
D =
μ + μwXw/X DC
exp > DC thr
④
물질전달 제한 (불완전혼합과 유사)
이용할
수 있는 배지가 적어짐
dX/dt
= μX- DXM = 0 D =
μX/XM
XM>X X/XM <
1 DC
exp < DC thr
예)
C16가 0.5%
일 때, DC가 0.25
h-1; C16가 1.0%
일 때, DC가 0.16
h-1
5)
Chemostat의 변형
(1)
세포 재사용 연속배양
세포
재사용; 연속적인 접종, 무균적으로 연속원심분리는 큰
규모에서 가능
①
특징
1.
system의 안정성 증가
2.
공정 중 변화 최소화
3.
고농도에서 정상상태 유지
4.
생산성의 증가; 희석율이 최대 비 성장속도보다 높다.
②
세포수지
α:
재사용율, C: 농축율 F (1+α)F,
X1
αF
Reactor 연속원심분리기 F1, X2
CX1 (농축세포)
첨가배지
중 세포 + 재사용 세포 - 세포 out + 세포성장 = 세포축척
F/V
XO + αF CX1/V -
(1+α)F X1/V + μX1 =
dX1/dt
αD
CX1 - (1+α)D X1 + μX1 =
0
μ=
(1+α)D
- αDC =
(1+α-αC)D (2-10)
C
> 1, 1+α-αC < 1 μ<D
③
기질수지
첨가배지
중 기질 + 재사용 기질 - 기질 out - 기질소비 = 기질축척
F/V
SO + αF S/V
- (1+α)F S/V
- μX1/YX/S =
dS/dt
DSO +αDS - (1+α)DS =
μX1/YX/S
X1
= YX/SD(SO-S)/μ (2-11)
(2-10)에서
X1
= YX/SD(SO-S)/(1+α-αC)D = YX/S(SO -S)/(1+α-
αC)
Monod 식에서
(2-12)
(2-13)
④
예) μmax = 1 h-1, μ =
0.8 h-1, YX/S
= 0.5, KS = 1 g/L,
SO
= 10 g/L, C = 2,
α
= 0.5
1.
No recyle
X = YX/S(SO-S) = 0.5 ×
(10 -1) = 4.5 g/L, DC = 1 h-1
2.
Recyle
X1
= YX/S(SO-S)/(1+α-αC) = 0.5 ×
(10 -1)(1+ 0.5 - 0.5 ×2) = 9 g/L
(2-10)에
의해서 DC = μmax
/
(1+α-αC)= 1/(1+ 0.5 - 0.5 ×2) =
2 h-1
(1+α)X1 = αCX1
+
X2,
X2= (1+α)X1-αCX1
=
(1+ 0.5)×9 - 0.5 × 2 × 9 = 4.5 g/L
(2)
2단계 연속배양
F,
SO X1, S1
(F', SO') F(2), S2, X2
①
1단계
μ1= D1, X1 = YX/S
(SO - S)
②
2단계 세포수지
1단계
세포 in - 2단계 세포 out + 2단계 세포성장 =
2단계세포축척
F/V2 X1 - F/V2 X2 + μ2X2 = dX2/dt
D2 X1 - D2 X2 + μ2X2 = 0
μ2
=
D2
(1 - X1/X2 ) (2-14)
X1/X2
<
1, μ2 < D2
③
2단계 기질수지
1단계
영양분 in -2단계 영양분 out - 2단계 영양분 소비=
2단계영양분 축척
F/V2 S1 - F/V2 S2 - μ2X2/YX/S =
dS2/dt
D2 (S1
- S2) = μ2X2/YX/S
X2 = YX/S
D2(S1 - S2)/μ2 (2-15)
(2-14)와
(2-15)에서
YX/S = μ2X2/D2(S1
- S2) = D2 (1 - X1/X2 )X2/D2(S1 - S2)
= (X2 - X1)/(S1 - S2) (2-16)
(3)
다단계 연속배양
①
n단계 세포수지
n-1단계
세포 in - n단계 세포 out + n단계 세포성장 =
n단계 세포축척
F/Vn Xn-1 - F/Vn Xn + μnXn = dXn/dt
Dn Xn-1 - Dn Xn + μnXn = 0
μn
=
Dn
(1 - Xn-1/Xn ) (2-17)
Xn-1/Xn
<
1, μn < Dn
Dn (Xn - Xn-1) =
μnXn
=
(dXn/dt)Growth
if
D1
=
D2
=
.... = Dn
Xn - Xn-1
=
(dXn/dt)Growth/D (2-18)
dX/dt vs
X, slope
= D (반원
모양)
X1은 X0에서 시작하여
기울기 D와 dX/dt가 만난점의
x절편,
X2은 X1에서 시작하여
기울기 D와 dX/dt가 만난점의
x절편
회분식
배양 dX/dt
=
DX
dX1/dt
- 0 = D (X1 - X0), dX1/dt는 X1의 y절편
②
n단계 기질수지
n-1단계
영양분 in -n단계 영양분 out - n단계 영양분 소비=
n단계 영양분 축척
F/Vn Sn1 - F/Vn Sn - μnXn/YX/S =
dSn/dt
Dn (Sn-1
- Sn) = μnXn/YX/S
Xn = YX/S
Dn(Sn-1 - Sn)/μn (2-19)
(2-17)와
(2-19)에서
YX/S = μnXn/Dn(Sn-1
- Sn) = Dn (Xn - Xn-1)/Dn(Sn-1 - Sn)
= (Xn - Xn-1)/(Sn-1 - Sn) (2-20)
(4)
다단계 연속배양의 목적
①
모든 기질의 이용
glucose(1단계)와
maltose(2단계)의 혼합물
②
성장 저해제가 있거나 1단계 chemostat에서 steady state를
얻기 어려운 경우
steady
state growth를 얻기 위하여 사용
③
2차 대사산물의 생산
1단계:
growth stage (높은 D, 성장 최적조건)
2단계:
production stage (낮은 D, 생산 최적조건)
④
재조합 미생물의 배양(단단 chemostat는 사용불가)
1단계:
유도물질 첨가하지 않음 -> plasmid가 없는 세포가 성장의
장점이 없다
(높은
D, 성장 최적조건)
2단계:
유도물질 첨가 -> 산물은 많이 생산하나 성장속도가
많이 감소, plasmid가
없는
세포가 성장에는 유리
(낮은
D, 생산 최적조건)
1)
정의
:
회분식 배양에서 연속적으로 배지를 첨가하고 배양이 끝날
때까지 배양액을 빼내지 않는 반연속식 또는 가변체적식 연속배양
■
반복 유가식배양 (Repeated fed-bach culture): 배양액의
일부를 반복적으로 제거하는 배양
2)
이용
①
고농도 균체를 얻음
②
기질저해 극복: ethanol, methanol 등
③
Catabolite repression 극복: 기질이용속도를 제한: 포도당
④
Glucose effect 제거
⑤
배양시간의 확대: 항생제
⑥
수분 증발의 보충
⑦
배양액의 점도감소
⑧
Auxotroph의 배양
⑨
균체수율의 증가: hydrocarbon
3)
분류
(1)
Feedback 제어가 없는 경우
①
일정 공급: F=일정, S=변화
기질이
제한됨, 생성산물 최대화
②
지수적 공급: F=지수증가, S=일정
기질이
제한 안됨, 균체농도 최대화
③
간헐 공급: 편리
(2)
Feedback 제어가 있는 경우:
수학적
표현이 필요없다.
①
직접제어: methanol-stat(GC연결)
배양액안의
배지의 성분을 분석
②
간접제어: 대사반응에 따른 변동인자(pH, DO, OUR, QCO2, RQ)의
조절.
a.
일정값 제어, b. 최적제어
4)
일정 유속 유가식 배양법
x=[g/l], s=[g/l], p=[g/l], D=F/V=[1/h]
X=[g], S=[g], P=[g], V=[l]
F=[l/h]=일정
세포농도가
최대치에 도달하면 기질은 거의 고갈
(3-1)
(3-2)
(1)
세포농도
(3-3)
■
준정상 상태(Quasi-steady state):
시간에
따라 세포농도 x[g/l]가 일정
(3-4)
연속배양:
시간에 상관없이 , 유가배양: 시간이 증가 -> 감소, 감소
(2)
기질농도
기질
in - 기질 out = 기질축척
(3-5)
■
준정상 상태(Quasi-steady state): 시간에 따라 기질농도
s[g/l]가 일정
그러므로, (5)식은 다음과 같다
(3-6)
(3-7)
(3-8)
(3)
생성물농도 (qp=일정할
때, x=xm)
(3-2)에
의하여
(3-9)
5)
지수 유가식 배양법
(3-10)
(1)
세포농도
(3-11)
(2)
기질 농도
(3-6)에
의하여 ,
(3-10)에
의하여 (3-12)
3)
생성물농도 (qp=일정할
때, x=xm)
(3-10)에
의하여
(3-13)
6)
일정 유속 반복 유가식 배양법
(1)
qp가 일정할
때
tc: 반복시간(cycle
time)
Vc: 제거되기
직전의 배양액의 부피
γ:
최소부피/최대부피
(3-14)
(3-15)
(3-15)를
(3-14)에 대입
(3-16)
(2)
qp가 일정하기
않을 때
(3-14)에서
qp가 일정하기
않으면 다음과 같다.
if
qp
= 일정,
(3-17)
연속 배양에서는 ,
반복
유가식 배양에서 생산물 농도는 연속배양의 생산물 농도를
초과할 수 없다.
그러나,
준 정상 상태에서는 정상상태와 효소의 조성이 달라 생산물
형성을 촉진하는
경우도
있다.
예)
V= 1000
mL, F = 200
mL/h, SO= 100 g/L,
XO= 30 g, μmax=0.3 h-1, KS= 1 g/L
YX/S= 0.5 g/g,
PO=0 g/L
1.
VO 2.
준정상 상태에서의 S(g/L) 3.
t
=
2 h에서 X (g)
4.
qP = 0.2
g/g-h, t = 2 h에서 P (g/L)
답) 1.
V
= VO + Ft VO= 1000
- 200 × 2 = 600 mL
2.
D
= F/V
= 200/1000 = 0.2 h-1,
S = DKS/(μmax-D) = 0.2 × 1 /(0.3-0.2) = 2
g/L
3.
X= XO + FYX/St = 30 +
0.2 × 0.5 × 100 × 2 = 50 g
4.
P = 0 + 0.2 × 50 × (0.6 +
0.2 × 2 / 2) × 2 = 16 g/L
P n = 16/(1-0.6)
= 40 g/L
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