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우선 DNA pol는 3'-OH가 있어야 새로운 뉴클레오타이드 합성이 가능하므로 아무것도 없는 상태에서는 새로 합성을 시작할 수 없기 때문에 3'OH없이도 합성 가능한 RNA pol의 일종인 primase에 의해 RNA primer가 합성되는 건가요?
그 외에 "primer는 교정기능을 받지 않으므로 DNA primer가 그대로 남아있다면 복제된 DNA에는 상당량의 오류가 존재할 수 밖에 없어 RNA primer를 이용한 후 DNA pol에 의해 제거하여 정확한 서열의 DNA로 치환된다." 이 말은 생총에서 인용된 표현인데,
primer가 교정기능을 받지 않는 다는 게 정확히 무슨 이유인지 잘 모르겠네요.
primase는 교정기능이 없어서 그런건지, 아니면
만약 DNA primer가 제공되었다 하더라도 복제 개시에 사용되는 위치에서는 DNA pol라도 교정기능을 적용할 수 없는건지.. 헷갈립니다.
아 한가지 더!
지연가닥 복제시에는 오카자키 절편 연결시 RNA primer가 DNA pol의 5'→3' exonuclease 활성에 의해 제거되고 뒷 절편의 3'말단으로부터 다시 DNA가 중합되어 전환되는데 반해,
선도가닥 복제에서는 처음 단 하나의 RNA primer가 제거된 후 어떻게 다시 DNA로 전환되나요?
보통 telomere 문제는 지연가닥의 3'말단 문제라고 해서 마지막 오카자키 절편의 RNA primer 제거 후 3'OH를 제공해 줄 것이 없어서 생기는 문제인 것 같은데.. 선도가닥에서도 발생할 수 있지 않을까요? ㅠ
혹시 복제 원점을 기준으로 왼쪽에 선도가닥이고 오른쪽이 지연가닥인 경우 선도가닥의 제거된 RNA primer 자리를 지연가닥의 첫번째 오카자키 절편의 3'OH로부터 DNA합성 결과 채워질 수 있는건가요?
아.. 오랜만에 공부하려니 머리가 뒤죽박죽입니다..ㅠ
고수님들의 자세한 답변 부탁드려요
댓글
댓글 리스트-
작성자분자생물학대마왕 작성시간 14.11.08 1) 제 생각입니다. primase의 오류 교정율이 DNA polymerase보다는 낮을 것 같습니다.
2) DNA polymerase I에 의해 교체됩니다. 지연가닥의 첫 번째 오카자키 절편을 합성하고 이후 DNA polymerase I에 의해 RNA를 DNA로 교체합니다. 이때 선도가닥의 primer가 제거됩니다. -
작성자이번합격생 작성시간 14.11.08 개시자로 작용하는 RNA primer 는 쉽게 생각하시면 random primer 로 생각하심 됩니다. 따라서 primer는 교정 기능을 받지 않는것이구요. 인위적 실험에서는 DNA primer를 합성해서 사용하지만 생체내에서는 RNA 개시자만 사용되는 것으로 알고 있습니다. 반드시 대치 되어야 하죠. 진핵세포 같은 경우는 크로모좀 여러군데 있게 되고 각 말단 부터 시작하지는 않습니다. 다만 마지막 합서시 말단은 점차 줄어드니까 telomerase 가 필요한 이유가 되겠지요. Ecoli의 경우는 원형 DNA 이므로 선도 가닥의 Ori C 에서 처음 시작된 RNA primer는 돌아오는 pol에 의해 제거됩니다. (이때는 pol I이 사용되겠지요?? )
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작성자이번합격생 작성시간 14.11.08 정리해서 말씀드리면 진핵세포의 복제기점은 염색체 말단이 아니기 때문에 선도 가닥에서는 발생하지 않습니다. (진핵의 경우 ARS를 기점으로 한쪽 방향이 선도 가닥이면 다른 한쪽은 지연가닥이 되겠네요. 이해 되셨을 라나?? 그리고 복제원점기준으로 형성된 primer는 그 옆에서 오는 지연가닥의 오카자키에 의해 DNA 합성으로 채워집니다.
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작성자날아라 시츄♡ 작성자 본인 여부 작성자 작성시간 14.11.08 감사해요 필생 6-2문제를 보고 고민에 빠졌었거든요 그럼 일단 "복제시 생체내에서는 랜덤하게 RNA primer가 합성되므로 교정작용을 받지 않는다. 에너지적으로 비효율적이라도 나중에 다시 DNA pol에 의해 제거 및 DNA로 전환된다" 라고 정리하면 되겠지요? 단, PCR에서는 인위적으로 DNA primer 합성이 가능한거구요. 선도가닥은 복제원점을 보지 않고 그냥 단순히 선행DNA만 봐서 헷갈렸나봐요~
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작성자날아라 시츄♡ 작성자 본인 여부 작성자 작성시간 14.11.08 마지막으로 하나만 더 물어볼께요^^; DNA ligase가 틈을 메울때 ATP 가수분해E를 필요로하는게 ATP->PPi로 분해되면서 나온 AMP가 5'과 3'사이 인산이에스터결합을 촉진하기 때문인가요?//
helicase 역시 ATP를 이용해서 DNA를 분리한다는데 이때 정확히 어느 단계에서 이용하는 건가요? 책엔 DNA가 특정 방향으로 이동하기 위해 필요한 화학E를 ATP가수분해를 통해 얻는다고만 나와있어서요..
생화학책에 DnaA가 먼저 이중나선을 분리할때 ATP와 결합시에 활성형이 되어 가능하고 그 후 ADP와 결합시엔 비활성형이 된다는 것과 연관된건가요? 예전엔 그냥 ATP 가수분해E를 이용한다고만 보고 말았는데 갑자기 궁금해지네요..고수님 부탁해요^^